相对于开凿运河所需要的人力物力财力，两个湖的海拔落差也是很大的问题，相比于尼罗河与红海的几米的水位落差而言，这两个高原湖的落差达到了惊人的1096肘尺（548米），基伍湖是2920肘尺（1460米），帕特罗克勒斯湖是1824肘尺（912米）很可能需要建造无数船闸才可通行。但是通过对坦噶尼喀湖的海拔高度探测，帕特罗克勒斯又否定了先前的想法，因为坦噶尼喀湖的海拔只有1548肘尺（774米），相对于帕特罗克勒斯湖的1832肘尺，相差还要大。而帕特罗克勒斯湖离基伍湖相差23.6帕拉桑，南面上游的鲁特绍鲁河中端离基伍湖约11帕拉桑，相较于两处的距离来看，总体坡度约为0.5度，这个海拔差也就不算什么了。
古希腊时期探测海拔高度的方法是通过三角测量法进行的，这种方法利用了三角形的特性，通过测量角度和边长来计算高度。早在两百多年前，古希腊哲学家泰勒斯就提出了估算金字塔高度的方法，他在地上竖起一根小木棒，通过测量木棒的高度和木棒影子的长度，计算出太阳光与地面的夹角。然后，利用这个角度和金字塔影子的长度，计算了金字塔的高度。
这种方法基于的原理是，如果在同一时间测量一个小物体的高度和它的影子长度，可以推算出太阳光与地面的夹角。接着，利用这个角度和要测量物体（如金字塔）的影子长度，可以计算出物体的高度。这种方法不仅适用于测量金字塔，也适用于测量其他高度较高的物体，如山峰。尽管这种方法相对简单，但它展示了利用几何原理进行高度测量的基本思想，对后来的测量技术产生了深远的影响。
现在唯一所需要担心的是流量问题，因为基伍湖的深度据帕特罗克勒斯探查平均也就200多肘尺（实际117米），就算流干了，河床的海拔高度也要远远高于南北的两个湖泊。但是帕特罗克勒斯还有一张王牌就是万一出现水量不够的问题，可以将西侧通往洛瓦河的河道封住，基伍湖到洛瓦河的溢出量较大。只要运河的水量小于洛瓦河，则不可能出现基伍湖流干的问题。另外还可以在鲁济济河与洛瓦河段建造大坝控制流量，所以事实上这条运河是完全不需要建造船闸的。
其实非洲这块大湖区，从最北边儿的奥林匹亚斯湖，往南到帕特罗克勒斯湖、基伍湖、坦噶尼喀湖和马拉维湖，这一大串湖泊其实都是在东非大裂谷里。在远古时代，坦噶尼喀湖的湖水曾经通过东非大裂谷注入到艾伯特湖，继而进入尼罗河。也就是说，在远古时代，尼罗河的长度比现在还要长一千多公里。
但是到了中新世，维龙加山脉火山爆发，把这条河道给堵了，从此坦噶尼喀湖就跟尼罗河没什么关系了，所以卡盖拉河成为了尼罗河的最远源头。但同时也说明，两个湖之间的打通基本不会出现基伍湖水流干的问题。
但是两个湖之间的维龙加火山带却成了最大的障碍，挖岩浆可比挖泥土难了无数倍。帕特罗克勒斯让城里的铁匠铺全力打造铁镐、铁锹、铁凿子和铁锤，并让木匠们制作扁担、运输车，妇女们则用藤条编织起了大量藤框、藤篓等容器。
维龙加火山有8个主要的火山，其中位于东南方向的卡里辛比火山海拔最高，达到4507米。在山脉中部和东部有6座死火山，以米凯诺火山和萨比尼奥火山为最老，始于更新世早期，火山口已经消失，侵蚀成崎岖地形。山脉西端的尼拉贡戈火山和尼亚姆拉吉拉火山形成还不到2万年，有许多火山口，熔岩仍在活动，并远流到基伍湖。
其中，尼拉贡戈火山位于维龙加山脉西端，是非洲最危险的火山之一。尼拉贡戈火山火山口直径2000米，深244米。从诞生至今，尼拉贡戈火山一直保持着活动的状态，每天释放出来的二氧化硫气体达数万吨。还好它在山脉的西面，要是横亘在中间就彻底歇菜了。饶是这样，时不时还是有硫磺的味道能传到中部，只不过不是很浓，达不到致死量。
维龙加山脉仍保存着原来树林的残迹：较高的地方密密麻麻地长着竹子；再高处是交织在一起的树木、灌木和草地；在3000米的高度上生长着硕大无比的扫帚树、山埂叶和狗舌草；而在4000米以上，几乎只有苔藓、青草和地衣能够生存了。此外，这里还居住着180余种鸟雀和60多种哺乳动物，有豹、灵猫、鬣狗、胡狼、水牛、野猪、大猩猩和象等。
维龙加山脉耸立於人口稠密的高原之上，高原主要居民是卢安达耕种者，某些地区住着牧牛者。帕特罗克勒斯从这些人中挑选了一些熟悉地形的人充为向导。经过多日的研究，在尽量避开火山的前提下，帕特罗克勒斯在图稿上勾勒出了一条最适合的开挖线路后，在南面河口奠基、动工。
当然，这条河道的开掘用时必然旷日持久，没个两三年根本不够，而且人数也是大大的不足，所以帕特罗克勒斯向西面的刚果腹地持续深入，抓了两三万奴隶，让整个刚果河中上游为之一空，没被抓走的也逃向刚果河左岸更远的地方了。帕特罗克勒斯把他们按照各自的氏族组建了公社组成开挖队伍，给他们分配各自的路段。
挖运河和挖矿劳动强度差不多，死亡率非常高，所以帕特罗克勒斯在两岸建起了砖瓦房，并在每个开挖的点上各安排一位医师和若干帝国公民协助公社社长进行管理。每个奴隶有每天0.5个奥波的收入，并承诺只要河道开挖结束后所有人将免除奴隶身份，完成效率高的公社将获得额外的奖赏。
这点钱只够每天填饱肚子的，不过政府是管饭的，而且为了维持奴隶们的体力，还得荤素搭配，甚至还给他们配了每人一身衣服，所以0.5奥波是纯收入。当然，黑人没什么存钱的概念，这点钱正好够他们买个半升酒的。黑人女子小孩允许他们和丈夫生活在一起，女人负责端茶倒水、做菜送饭和浣洗衣服，只管饭而没有工资，但连同孩子一起管饱。这工资待遇是真的低的可怜，但也算没有虐待他们，还能让他们一家团聚，非常人性化。
为了挖掘河道，帕特罗克勒斯在帕特罗克勒斯湖上游河流的拐口处建了一座城镇，作为物资存储中心，把需要的东西从尼罗河的亚历山大城运输到此。在安排好一切之后，帕特罗克勒斯留下5000左右的士兵看管十倍的工人，然后回到了尼罗河的亚历山大城。
此时这位远征军总指挥拥有士兵人左右和大小船只200多艘，他们在载满了补给品后浩浩荡荡地杀向了300多帕拉桑以外的阿卢特地区。经过20来天的行船之后，众人接近到了阿卢特地区，并派人绕到麦罗埃通知了小托勒密。
小托勒密立马带着一万多人杀进了阿拉巴和那卡，然后一路向南杀过来。阿卢特立即率领舰队搭载着多士兵向北面杀去，留下5000多人留守阿尔瓦。帕特罗克勒斯趁机率军登陆阿尔瓦的左岸，通过奇袭突破了城门，但帕特罗克勒斯小看了阿卢特人的战斗意志，双方经过了激烈的巷战，结果5000多人的守军最后只剩下不到1000人，帕特罗克勒斯也损失了1500多人。而远在18帕拉桑以外的阿卢特主力被小托勒密拖住，无法立即回返，错过了拯救阿瓦尔城的机会，最后在国王一纸降表送达只和你全都成了小托勒密的俘虏。
至此，长达1200多帕拉桑的尼罗河及超过帝国十分之一领土的尼罗河流域的土地被彻底掌控在帝国手中。等到运河开通，流域面积将扩大15%，帝国对黑非洲的控制力将得到更大的加强。